O Conselho de Coordenação do Centro de Ciências da Saúde é constituído pelo Decano, que o presidirá, pelos Diretores das Unidades e dos Órgãos Suplementares que integram o CCS, por representantes dos estudantes, professores e servidores técnico-administrativos, bem como pelos representantes do CCS nos Colegiados Superiores da UFRJ e convidados do Presidente do Conselho.

No âmbito de suas competências, cabe ao Conselho de Coordenação do CCS:

• Promover a coordenação e integração do ensino, da pesquisa e da extensão nas Unidades e Órgãos Suplementares;
• Promover ou apreciar propostas relativas à adaptação das Unidades e Órgãos Suplementares às exigências do desenvolvimento cultural e científico;
• Orientar as Unidades na elaboração e revisão dos respectivos Regimentos, respeitadas as peculiaridades de cada um;
• Coordenar a elaboração de planos e programas de ensino, de pesquisa e de extensão anuais e plurianuais, apresentadas pelas Unidades e Órgãos Suplementares;
• Apreciar as propostas de criação de cursos de Pós-Graduação, de iniciativa das Unidades, antes de seu encaminhamento ao Conselho de Ensino para Graduados.